弄扣款协议的原因主要可以归纳为以下几点：

税务合规性

三方协议：企业、税务局和银行之间签署协议，允许税务局直接从企业开户银行扣划已申报的税款。这样做既方便企业，也减轻了税务局的人工收税负担。

个体户代扣税协议：为了加快扣款速度，税务机关指定银行批量扣款，个体户只需办理储蓄卡即可签署协议。

商业合作中的交易保障

供应商扣款协议：为了确保供应商在品质、成本、交期和服务等方面达到要求，约束供应商的不规范行为，并制定处罚条例，作为品质保证协议的补充条款。

补充协议：在商业合作中，如果涉及到较高金额的扣款，双方可以签订补充协议，明确扣款的起因、金额和退款条款等，以保护双方权益，避免争议。

自动化和便捷性

自动扣款：某些支付平台如拼多多，用户选择“协议扣款”后，系统会在订单满足条件时自动扣款，省去了每次支付时手动输入密码或验证的步骤，提高了购物和支付效率。

避免人工操作错误：通过协议扣款，减少了人为操作的空间，从而降低了因操作失误导致的损失。

明确责任和权限

代扣协议：定义了哪些款项可以扣款，哪些不可以，以及扣款的具体条件和流程，确保扣款行为的合法性和透明性。

综上所述，弄扣款协议的主要目的是为了确保税务合规、保障商业合作的顺利进行、提高交易效率以及明确各方的责任和权限。