如果发现手机在维修过程中零件被偷换，可以采取以下措施：
与商家协商
首先，尝试与商家进行协商，看是否能够达成一个双方都能接受的解决方案。
如果协商无果，可以要求商家提供维修前后的零件对比，或者要求商家承担相应的赔偿责任。
向消费者协会投诉
如果协商未能解决问题，可以向当地的消费者协会投诉，请求其介入调解。
消费者协会会根据相关法律规定，协助双方达成和解或提供其他必要的帮助。
收集证据
在整个过程中，务必保留所有相关的证据，如维修前后的手机照片、维修记录、付款凭证等。
这些证据在后续的投诉或诉讼过程中将起到关键作用。
提起诉讼
如果协商和投诉都无法解决问题，可以考虑通过法律途径向法院提起诉讼。
根据《消费者权益保护法》，如果商家存在欺诈行为，可以要求增加赔偿，通常为购买商品价款的三倍，不足五百元则按五百元计算。
报警处理
如果怀疑零件被偷换涉及刑事犯罪，可以向公安机关报案，由公安机关依法进行调查处理。
根据《中华人民共和国治安管理处罚法》，盗窃行为可能会受到相应的法律处罚。
建议
选择信誉好的维修店：尽量选择经营时间较长、信誉较好的维修店，以减少被偷换零件的风险。
签订维修协议：在维修前，与商家签订详细的维修协议，明确维修内容、费用及零件更换的相关条款。
及时行动：发现零件被偷换后，应尽快采取行动，以免证据丢失或权益受损。
通过以上措施，可以有效地维护自己的合法权益，避免因手机维修零件被偷换而遭受损失。