合作开店股份的分红方式通常有以下几种：

按出资比例分配：

这是最常见的股份分配方式，根据合伙人各自的出资额占合伙企业总出资额的比例来分配股份。这种方式简单明了，适用于资金投入较大的项目，可以保证出资较多的一方在决策中拥有更大的话语权。

按贡献分配：

在某些情况下，出资并不是决定股权分配的唯一因素。合伙人可以根据各自的能力、经验、技术等贡献进行股份分配。这种方式有利于激励合伙人发挥自己的专长，为店铺的发展做出更大的贡献。

协商分配：

合伙人之间可以通过协商一致，依据各自的资源、能力和市场前景等因素来决定股份分配。协商结果可以是比例式的，也可以是绝对式的。

按利润再投资分配：

合伙企业的利润可以选择部分再投资，按照再投资额来调整各合伙人的股份比例。

按风险承担分配：

考虑到合伙人承担的风险大小不同，可以依据风险承担的程度来分配股份。

综合分配：

有些情况下，股份分配可以综合考虑多种因素，如出资比例、贡献、风险承担等，通过协商确定一个公平的分配方案。

在实际操作中，建议合伙人之间充分沟通，明确各自的期望和贡献，并通过书面协议形式确定股份分配的具体方式和比例，以减少后续的纠纷。如果合伙协议未约定或者约定不明确，可以由合伙人协商决定；协商不成的，按照实缴出资比例分配；若无法确定出资比例，则由合伙人平均分配。