百合花的种子通常呈 扁平或略带椭圆形的小颗粒，大小一般在2毫米至5毫米之间。颜色方面，新鲜的百合种子多为淡褐色或浅棕色，随着干燥程度的增加可能会变得更深。种子表面较为光滑，有时可以观察到细微的网状纹理或是种子固有的斑点。从外表皮看，百合种子大多是褐色或者是黑色的。
此外，百合花的种子在蒴果中成熟，种子数量较多，呈卵形且比较扁平。种子成熟后，可以通过摘下枯萎的花来采收种子，直接将种子倒出来。
综上所述，百合花的种子呈扁平或略带椭圆形的小颗粒，颜色多为淡褐色或浅棕色，表面光滑，有的品种种子边缘有轻微的褶皱或纹理。种子由种皮、胚乳（部分百合种类可能不明显）和胚三部分组成，胚是未来植株生长的基础。