海关稽查主要对以下内容进行核查和监督：
会计账簿和凭证
海关稽查会查阅与进出口货物直接相关的企业、单位的会计账簿、会计凭证以及其他相关资料，以确保这些记录的真实性和合法性。
报关单证
海关稽查会核查相关的报关单证，包括提单、航空运单、进口许可证、出口许可证等，以确认货物的运输细节和所需的许可证件。
货物一致性和合规性
稽查人员会检查实际货物是否与申报的信息一致，包括货物描述、数量和重量、包装等，并确认货物是否符合关税分类、税费支付、许可证和批准文件等要求。
安全与卫生标准
对于特定商品如电子产品、化学品、食品、药品等，海关稽查会检查其是否符合相关的安全和卫生标准，以防止病虫害传播和环保要求。
知识产权保护
海关稽查会检查货物是否涉及商标侵权、版权问题和专利侵权，以保护知识产权。
禁限物品检查
稽查人员会检查是否有禁止进口或限制进口的物品，如毒品、武器、文物、濒危物种制品等，确保这些物品不被非法进出口。
包装材料与标签
海关稽查会检查货物的包装是否完好，是否有损坏或篡改迹象，并核实包装材料与标签的合规性。
加工贸易业务
对进口环节和加工生产环节进行稽查，检查是否存在高报单耗、串换料件等违法行为。
一般贸易业务
审查货物价格情况、归类情况、数量情况，以及货物的会计记录、收发货记录、出入库记录等。
减免税设备业务
检查减免税货物的申报准确性、使用情况及管理情况。
外部审计和后续监管
海关稽查通过外部审计的方式，核查被稽查人的单证流、货物流、资金流，还原其贸易实质，并实施后续监管。
职权行使
海关在稽查过程中可以行使查阅、复制账簿和单证、进入生产经营场所检查、询问相关人员等职权。
信息收集
海关可以根据稽查工作需要，向相关行业协会、政府部门和企业收集特定商品、行业与进出口活动有关的信息，并在必要时保密。
查封、扣押
在紧急情况下，海关可以查封、扣押可能被转移、隐匿、毁弃的账簿、单证及相关电子数据存储介质。
专业结论
海关可以委托会计、税务等方面的专业机构就相关问题作出专业结论，作为稽查的参考依据。
综上所述，海关稽查旨在全面监督企业的进出口活动，确保其真实性和合法性，涉及从账簿凭证到货物本身，从合规性到知识产权保护的多个方面。