日本东京大学在世界大学排名中通常位于前列，与国内的清华大学和北京大学相当。根据2024年QS世界大学排名，东京大学位列第28位，而清华大学和北京大学分别位列第15位和第23位。尽管排名有所波动，但东京大学在国内的对应档次可视为 顶尖大学。
东京大学在多个学科领域具有世界级的学术影响力，包括理学、医学、文学、工学和政治学等，特别是在土木和建筑学领域更是处于最尖端的位置。此外，东京大学的诺贝尔奖得主人数也颇为突出，显示出其在全球学术界的高水平地位。
综上所述，可以认为东京大学在国内的档次相当于清华大学和北京大学，属于顶尖大学行列。