根据提供的信息，以下是不能在农村建房的几个主要区域：

永久基本农田：

根据《土地管理法》，任何单位和个人不得擅自占用或改变永久基本农田的用途。

水源地：

包括饮用水源一级保护区，建房可能会影响水质，因此在这些区域建房是禁止的。

保护区：

包括生态资源保护区、历史文化核心保护范围等，建房可能会破坏这些区域的生态或文化资源。

公路两侧控制区：

为了保障公路的安全和畅通，国家规定在农村公路两侧一定范围内不能建房。

历史文化保护区：

在这些区域内建房可能会对当地的历史文化造成影响。

其他法律法规规定的禁建区：

包括河道湖泊管理区、法律、法规规定的其他禁止住房建设区域。

需要注意的是，建房必须符合当地土地利用总体规划和乡镇总体规划，并且需要办理完备的审批手续。否则，即使建好了房子，也可能会被认定为违法建筑，面临拆除等处罚。